С 2016 года Предприятием оказываются услуги по созданию и обновлению ведомственных электронных навигационных карт (ЭНК) и цифровых справочно-информационных наборов (ЦСИН) на акваторию Северного морского пути, акватории морских портов СМП и подходы к ним.

Согласно стандарту S-62 Предприятию Международной гидрографической организации (МГО) присвоен официальный код производителя ЭНК R1.

Коллекции ЭНК и ЦСИН постоянно пополняются по материалам новых съемок рельефа дна, выполняемых Предприятием. Поддержание всех созданных ЭНК и ЦСИН в актуальном состоянии обеспечивается путем их еженедельного обновления.

С 06 июня 2022 года ФГУП "Гидрографическое предприятие" является официальным распространителем государственных электронных навигационных карт Управления навигации и океанографии Минобороны России на морские воды национальной юрисдикции Российской Федерации (далее- ЭНК УНиО).